پی سی آر کا اصول ڈی این اے کا استعمال کرنا ہے جو وٹرو میں 95 ° C کے اعلی درجہ حرارت پر منحرف ہو جاتا ہے اور اکیلا ہو جاتا ہے۔ کم درجہ حرارت پر (عام طور پر 60 ° C کے ارد گرد)، پرائمر اور سنگل اسٹرینڈز کو بنیادی تکمیلی جوڑی کے اصول کے مطابق ملایا جاتا ہے، اور پھر درجہ حرارت کو DNA پولیمریز میں ایڈجسٹ کیا جاتا ہے۔ زیادہ سے زیادہ رد عمل کے درجہ حرارت پر (تقریباً 72 ° C)، DNA پولیمریز فاسفورک ایسڈ کی سمت کے ساتھ پانچ کاربن شکروں (5'-3') کے ساتھ تکمیلی تاروں کی ترکیب کرتا ہے۔
پی سی آر کا سب سے قیمتی اطلاق کا علاقہ متعدی بیماریوں کی تشخیص ہے۔ نظریہ میں، جب تک نمونے میں ایک روگزنق موجود ہے، پی سی آر کا پتہ لگایا جا سکتا ہے۔
تجربات میں، یہ پایا گیا کہ ڈی این اے کو زیادہ درجہ حرارت پر بھی ڈینیچر کیا جا سکتا ہے اور پگھلا بھی جا سکتا ہے، اور درجہ حرارت کم ہونے پر اسے دوبارہ دوہرے کناروں میں تبدیل کیا جا سکتا ہے۔ لہٰذا، درجہ حرارت کی تبدیلیوں کے ذریعے ڈی این اے کی تزئین و آرائش کو کنٹرول کرتے ہوئے، ڈیزائن پرائمر، ڈی این اے پولیمریز اور ڈی این ٹی پیز کو شامل کرکے مخصوص جینز کی ان وٹرو نقل کو مکمل کر سکتے ہیں۔
تاہم، ڈی این اے پولیمریز اعلی درجہ حرارت پر غیر فعال ہو جائے گا. لہذا، ہر ایک سائیکل میں نئے ڈی این اے پولیمریز کو شامل کرنا ضروری ہے، جو نہ صرف کام کرنے کے لیے بوجھل ہے، بلکہ مہنگا بھی ہے، جو پی سی آر ٹیکنالوجی کے استعمال اور ترقی کو محدود کرتا ہے۔







