رنگین PCR پلیٹ کو جراثیم سے پاک DNA RNA مفت کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے۔

کلر پی سی آر (کلر کمپلیمنٹ پرکھ) لفظی طور پر ترجمہ کرتا ہے"؛ رنگ کی تکمیل کا پتہ لگانے"؛، جو کہ LP-PCR کی ایک قسم ہے۔ کلر پی سی آر کا واضح ترجمہ ہے: یہ پرائمر کے 5'؛ آخر کو لیبل کرنے کے لیے فلوروسینٹ ڈائی کا استعمال کرتا ہے۔ فلوروسینٹ رنگ JOE اور FAM گرین فلوروسینس ہیں؛ تمرا سرخ فلوروسینس ہے؛ COUM بلیو فلوروسینس ہے۔ مختلف فلوروسینٹ لیبل والے پرائمر ایک ہی وقت میں رد عمل میں حصہ لیتے ہیں، اور ایمپلیفائیڈ ٹارگٹ جین پرائمر کے 5'؛ آخر میں ڈائی کا حامل ہوگا۔ الیکٹروفورسس یا سینٹری فیوگل ورن کے ذریعے، ننگی آنکھ یہ فیصلہ کر سکتی ہے کہ آیا ہدف جین موجود ہے اور مختلف فلوروسینس کے رنگ کے مطابق ایمپلیفائیڈ جین کی قسم۔ . عام طور پر مختلف رنگوں کے صرف دو پرائمر کی ضرورت ہوتی ہے، ایک کو جین کا پتہ لگانے والے پرائمر کے طور پر استعمال کیا جاتا ہے۔ دوسرے کو داخلی کنٹرول کے طور پر استعمال کیا جاتا ہے تاکہ حالات کو کنٹرول کیا جا سکے تاکہ جین کے خاتمے، کروموسومل ٹرانسلوکیشن یا کسی خاص وائرس سے انفیکشن کی تشخیص کی جا سکے۔ ایک سے زیادہ پوائنٹ کی تبدیلیوں کا پتہ لگاتے وقت، مزید رنگ استعمال کیے جا سکتے ہیں۔ مثال کے طور پر، جینیاتی بیماریاں جن میں ایک سے زیادہ پوائنٹ میوٹیشنز، متعدد مشتبہ وائرل انفیکشنز، اور HLA سائٹ کا تجزیہ ایک ہی وقت میں متعدد سائٹس کا پتہ لگانے کے لیے کلر پی سی آر کا استعمال کر سکتا ہے۔